念珠藻类psbA基因的进化分析

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【作者】魏爱丽，杨谢，王捷，巩超彦，王清华，李艳晖
【刊名】河南师范大学学报(自然科学版)
【作者单位】¹太原师范学院生物系；²山西中医药大学实验管理中心
【年份】2023
【卷号】第1期
【页码】114-122
【ISSN】1000-2367
【关键词】念珠藻 psbA基因正向选择负向选择
【摘要】蓝藻psbA基因家族编码不同形式的D1蛋白,该蛋白是光系统II反应中心的重要组成部分.以39条念珠藻属及与其同源性较高的psbA基因序列为研究对象,构建最大似然树进行系统发育分析,然后运行PAML4.9软件,使用分支模型、位点模型和分支-位点模型估测氨基酸位点ω值,进一步探讨psbA基因所受到的选择压力.结果表明:系统发育树呈现出内类群中念珠藻分为2个大分支.在分支-位点模型和位点模型下检测出13S,42V,75S,152R和255K为统计学上显著的正选择位点,绝大多数为负选择位点.揭示了念珠藻...
【基金】国家自然科学基金
【文献类型】期刊