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粘虫转录组中SSR位点的信息分析

  • 【获取途径】 超星期刊网
  • 【作者】胡艳华,李敏,张虎芳,李生才,王青,赵惠玲
  • 【刊名】山西农业大学学报(自然科学版)
  • 【作者单位】山西农业大学农学院;太原师范学院生物系
  • 【年份】2015
  • 【卷号】第5期
  • 【页码】484-489
  • 【ISSN】1671-8151
  • 【关键词】粘虫 转录组 SSR 重复类型 重复基元 
  • 【摘要】 粘虫Mythimna separata(Walker)是一种迁飞性害虫,严重危害玉米、水稻、小麦等粮食作物。SSR是指以1~6个核苷酸为基本重复单位的串联重复DNA序列。SSR位点的信息分析为粘虫扩散、迁飞和交配等行为分子机制的研究以及粘虫的综合防治奠定理论基础。本研究基于高通量测序获得的粘虫转录组数据,利用软件msatcommander发掘粘虫SSR位点。结果从20 776条转录组Unigenes中共搜索出400个SSR,分布于372条Unigenes中。在粘虫转录组SSR中,三核苷酸重复的数...
  • 【基金】国家自然科学基金
  • 【文献类型】 期刊
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