中华大仰蝽转录组学研究及SSR新标记开发

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【作者】李敏，张丹丽，李荣荣，雷廷，宋鲜梅，卜文俊
【刊名】昆虫学报
【作者单位】太原师范学院生物系；南开大学生命科学学院昆虫学研究所
【年份】2022
【卷号】第1期
【页码】31-43
【ISSN】0454-6296
【关键词】中华大仰蝽转录组 SSR 基因注释 Illumina NextSeq
【摘要】 [目的]中华大仰蝽Notonecta chinensis为中国和日本冲绳分布的重要水生天敌昆虫,可用于蚊虫的生物防治。本研究旨在建立中华大仰蝽转录组数据库,挖掘其基因信息。[方法]采用高通量测序平台Illumina NextSeq500对中华大仰蝽进行转录组de novo测序、序列组装及生物信息学分析;利用MISA软件基于转录组unigenes数据进行SSR新分子标记筛选。毛细管电泳检测SSR多态性。[结果]总计获得34 782 282条clean reads,组装成37 801条unigene...
【基金】国家自然科学基金
【文献类型】期刊