甘蔗E3泛素连接酶基因PRT1的生物信息学及表达模式分析

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【获取途径】超星期刊网
【作者】李姗姗，黄梦婷，青雨虹，许静，黄君梅，凌辉，阙友雄，黄宁
【刊名】华北农学报
【作者单位】¹玉林师范学院生物与制药学院广西高校亚热带生物资源保护与利用重点实验室；²太原师范学院生物系；³福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心
【年份】2023
【卷号】第38卷
【期号】第1期
【页码】168-177
【ISSN】1000-7091
【关键词】甘蔗 ScPRT1 泛素连接酶生物信息学表达模式
【摘要】为探究甘蔗PROTEOLYSIS 1基因与黑穗病菌的互作关系，以甘蔗割手密种和栽培品种为研究对象，通过RT-PCR技术对ScPRT1基因进行克隆，生物信息学分析、定量PCR、亚细胞定位和基因共表达网络分析。生物信息学分析表明，该基因的cDNA全长为1 621 bp,包含一个长度为1 260 bp,编码419个氨基酸的完整开放读码框；其编码蛋白的分子量为46.56 ku,为酸性、不稳定的亲水蛋白，无信号肽，具有核定位信号；该蛋白包含2个RING结构域和1个ZZ结构域；ScPRT1蛋白的高级结构元件...
【基金】国家自然科学基金;广西自然科学基金
【文献类型】期刊